Shopify, B2B e IVA: cómo gestionar VAT number, reverse charge e IVA intracomunitario (España y UE) – [2026]

Un problema clásico en Shopify, el CIF, CURP o VAT para gestionar los impuestos, parece que va teniendo una solución que se desplegará los próximos días.

Cuando en la mejor agencia Shopify del mundo mundial (Pango Studio, obviamente XD) nos llega algún proyecto en el que hay que gestionar facturación, siempre hay cuestiones a resolver con el CIF, el VAT o el CURP en México; tenemos solución para todos los casos, por raros que sean, pero la realidad es que algunos de estos temas son casí un Tabú en Shopify. Desde ahora, esto está cambiando. Te cuetno.

Vender B2B en Shopify dentro de Europa es rentable… hasta que llegas al IVA. Si no lo configuras bien, ocurren dos cosas: o cobras IVA cuando no toca (y pierdes conversión), o no lo cobras cuando toca (y te metes en un lío fiscal).

En este artículo te explicamos, de forma práctica, cómo funciona el IVA B2B en Shopify cuando vendes desde España a otros países de la UE: qué es el VAT number, qué significa “reverse charge” (inversión del sujeto pasivo), y qué configuraciones suelen romperse en tiendas reales.

1) El problema real: B2B no es “solo poner un campo de empresa”

En B2B europeo, el checkout debería ser capaz de hacer tres cosas:

  1. Permitir que el cliente indique que compra como empresa.
  2. Capturar un VAT number válido (NIF-IVA intracomunitario).
  3. Aplicar correctamente el IVA o la exención según el caso.
  4. Integración con tu ERP.

Cuando una de esas piezas falla, lo normal es ver:

  • Pedidos B2B intracomunitarios con IVA cobrado por error.
  • Empresas que abandonan el checkout porque no pueden introducir VAT o no se aplica la exención.
  • Facturas que no cuadran con lo que tu asesor necesita para declarar.

2) Qué es el VAT number y por qué importa en Shopify

El VAT number es el identificador de IVA de una empresa en Europa (en España suele ser el NIF-IVA cuando opera intracomunitariamente).
En la práctica, es el “pasaporte fiscal” que permite a Shopify (y a ti) identificar que el comprador es una empresa y que la operación puede tener un tratamiento distinto al B2C.

Ejemplo:

  • Empresa en España vende a empresa en Francia.
  • Si el cliente aporta VAT válido y se cumplen condiciones, la venta puede ir sin IVA.

3) Qué es “reverse charge” (inversión del sujeto pasivo)

El reverse charge (inversión del sujeto pasivo) es una regla por la que:

  • El vendedor no cobra IVA en la factura.
  • El comprador (empresa) autoliquida el IVA en su país (y normalmente se lo deduce si corresponde).

En e-commerce, esto aparece sobre todo en ventas B2B intracomunitarias (UE a UE, país distinto) y en algunos flujos con UK según configuración fiscal.

Traducción a negocio: para el comprador B2B, el precio “real” no debería llevar IVA en ese caso. Si tu checkout lo cobra, compites peor.

4) Cuándo aplica el IVA intracomunitario B2B (casos típicos)

En tiendas que venden desde España/UE, los escenarios más habituales son:

Caso A: España → España (B2B nacional)

  • Se aplica IVA normal (salvo regímenes especiales o excepciones concretas).
  • Aquí el VAT number no te “quita el IVA” por defecto.

Caso B: España → otro país UE (B2B intracomunitario)

  • Si el comprador aporta VAT válido y el envío es a un país distinto, suele aplicar reverse charge.
  • Resultado esperado: checkout sin IVA, factura con la mención correspondiente.

Caso C: España → UE (B2C)

  • Normalmente lleva IVA (con reglas de OSS/umbral, etc., según el caso).
  • No hay reverse charge.
  • El temido Recargo de Equivalencia…

La clave es que Shopify debe distinguir correctamente B2B de B2C y validar el VAT cuando corresponda.

5) Shopify B2B + IVA: configuraciones que marcan la diferencia

5.1 Activa correctamente la captura de VAT en checkout

Si vendes B2B en UE, necesitas que el checkout permita introducir “VAT number” (o equivalente). Sin eso, te obligas a procesos manuales (y el cliente abandona).

5.2 Revisa dónde está tu “fulfillment” (ubicación de envío)

En IVA, el país desde el que “cumples” el pedido importa. Si trabajas con varias ubicaciones (España, Alemania, 3PL, etc.), la lógica fiscal puede variar. Es una de las fuentes más típicas de “en staging funciona y en producción no”.

5.3 Facturación: que lo que cobras se pueda justificar

B2B sin un flujo de facturas consistente es un dolor. Debes asegurarte de que:

  • El pedido guarda el VAT del cliente.
  • La factura refleja correctamente el régimen aplicado (si hay reverse charge).
  • Tu contabilidad puede reconciliar pedidos, impuestos y facturas sin hojas manuales eternas.

6) Errores comunes que vemos en auditorías de Shopify B2B

Lista corta y directa:

  • Confundir “campo de empresa” con “flujo fiscal B2B”.
  • Capturar VAT en un formulario externo, pero no en checkout (mala conversión).
  • No diferenciar B2B y B2C en pricing (y acabar compensando con descuentos).
  • No alinear ubicaciones/fulfillment con la estrategia fiscal real.
  • Emitir facturas sin mención adecuada o sin VAT del cliente guardado.
  • Creer que “Shopify lo hace solo” sin revisar casos frontera.

7) Checklist rápido: ¿tu Shopify B2B de IVA está bien montado?

  • El cliente puede comprar como empresa sin fricción.
  • Puede introducir VAT en checkout (y queda guardado).
  • En B2B intracomunitario, el checkout no cobra IVA cuando corresponde.
  • En pedidos nacionales o B2C, el IVA se cobra bien.
  • Las facturas salen consistentes con el régimen fiscal aplicado.
  • Tu equipo puede auditarlo: pedido → impuesto → factura → contabilidad.

Si fallas en 1–2 puntos, normalmente hay impacto directo en margen o conversión.

8) Cómo te ayudamos en Pango Studio

En Pango Studio trabajamos Shopify enfocado a negocio: no solo “que funcione”, sino que cierre fiscalmente, convierta y sea escalable.

Lo que solemos hacer en un proyecto de Shopify B2B + IVA:

  • Auditoría del flujo B2B end-to-end (checkout, impuestos, facturas, ERP).
  • Recomendación de arquitectura (Shopify Tax, ubicaciones, reglas y excepciones).
  • Implementación y pruebas con casos reales (países, VAT válidos/invalidos, clientes B2C/B2B).
  • Documentación para tu asesoría y para tu equipo interno.

Si quieres, te lo dejamos cerrado en una sesión : revisamos tu caso (España/UE, ubicaciones, operativa B2B) y te decimos exactamente qué se puede automatizar y qué no.

Seguramente tengas algunas dudas:

¿Shopify soporta IVA intracomunitario B2B?

Sí, pero depende de tu configuración fiscal, de cómo capturas/validas el VAT y de tu operativa de ubicaciones y fulfillment.

¿Qué es reverse charge en Shopify?

Es el caso en el que el pedido B2B se factura sin IVA porque el comprador autoliquida el impuesto (inversión del sujeto pasivo), típicamente en operaciones intracomunitarias.

¿Necesito Shopify Plus para B2B con IVA?

No necesariamente. Lo importante es tu configuración fiscal y el stack (Shopify Tax, checkout settings, etc.). Plus ayuda en algunas personalizaciones, pero no es el “switch” mágico del IVA.

¿Qué pasa si el VAT es inválido?

Lo correcto es tratarlo como B2C o como B2B nacional según el caso, y cobrar IVA cuando corresponda. El gran error es “dejar pasar” VAT inválidos y facturar sin IVA.

¿Tienes una tienda Shopify B2B y el IVA te está reventando el margen o la conversión?
En Pango Studio hacemos una auditoría rápida y te decimos qué está mal, qué es automatizable y qué cambios te dan impacto directo.

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